RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 LIPJQ5W064 366 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 OR52E8Q6IFG1 317 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 EPS15L1Q9UBC2 864 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 USP22Q9UPT9 525 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 BAG2O95816 211 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A8O95907 504 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CATP04040 527 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FUCA1P04066 466 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GPIP06744 558 aa5.47□□□□□ -1.53
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