RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 OR2L3Q8NG85 312 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 CFAP36Q96G28 342 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 MIPEPQ99797 713 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 SNX7Q9UNH6 387 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 SNX24Q9Y343 169 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 FASNP49327 2511 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 GFYI3L273 518 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 GABRB3P28472 473 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 CMPK1P30085 196 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ARSFP54793 590 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 STEAP4Q687X5 459 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 DLG3Q92796 817 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 PKP4Q99569 1192 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TCFL5Q9UL49 500 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PPV9 198 aa22.07■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 PSMB5P28074 263 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 RGS4P49798 205 aa22.07■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 FAM198BQ6UWH4 519 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 NDNQ99608 321 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 ERP44Q9BS26 406 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 TP73O15350 636 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 SLC16A8O95907 504 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 CTSBP07858 339 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 MCM3P25205 808 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 C1orf189Q5VU69 101 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 IL10RAQ13651 578 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 GRM7Q14831 915 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 MLIPQ5VWP3 458 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF480Q8WV37 535 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPN4-208ENST00000460289 MKRN2OSH3BPM6 223 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 RFPL1O75677 317 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 C8GP07360 202 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 PMS2P54278 862 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.129e-7■■■■□ 22.7
PTPN4-208ENST00000460289 TAP2Q03519 686 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPN4-208ENST00000460289 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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