RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC27A1Q6PCB7 646 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 AAGABQ6PD74 315 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TEX38Q6PEX7 206 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CYB5R4Q7L1T6 521 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DDI1Q8WTU0 396 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 EDAQ92838 391 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RFKQ969G6 155 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 EGLN2Q96KS0 407 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SAMD8Q96LT4 415 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MUS81Q96NY9 551 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MMS19Q96T76 1030 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CIPCQ9C0C6 399 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ATG10Q9H0Y0 220 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NGBQ9NPG2 151 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HPS4Q9NQG7 708 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CENPMQ9NSP4 180 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CLIC4Q9Y696 253 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 XDHP47989 1333 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CEP162Q5TB80 1403 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NPATQ14207 1427 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CNTLNQ9NXG0 1405 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1W2PPM1 405 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA8OA6NCC3 632 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM202A6NGA9 273 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 AHRRA9YTQ3 701 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA8KD6RF30 607 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA8NF8WBI6 632 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PTGESO14684 152 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PEX1O43933 1283 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KLK8O60259 260 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SELENOFO60613 162 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CREG1O75629 220 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FLOT1O75955 427 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NCR1O76036 304 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms