RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TARM1B6A8C7 271 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9J4A7 227 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMAPO00193 183 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS26AO75436 327 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPC1LP0DKB6 136 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABRB3P28472 473 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIF1AQ16665 826 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASB11Q8WXH4 323 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THAP4Q8WY91 577 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNF8Q96H20 258 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDC1Q9BTX1 674 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GFYI3L273 518 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 J3QKU1 62 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP73O15350 636 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NRP2O60462 931 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTSVO60911 334 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RFPL1O75677 317 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJB5O75953 348 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCM3P25205 808 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GCGRP47871 477 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PNLIPRP1P54315 467 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARL4CP56559 192 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MLIPQ5VWP3 458 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPZQ66K79 652 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMPDL3AQ92484 453 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC39Q96DD0 335 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPTA1P02549 2419 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAST4O15021 2626 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARGFXA6NJG6 315 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUV39H1O43463 412 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC16A8O95907 504 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AHSGP02765 367 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NR1D1P20393 614 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CMPK1P30085 196 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSD17B2P37059 387 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHAF1BQ13112 559 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC9A5Q14940 896 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCTE1Q5JU00 501 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STEAP4Q687X5 459 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF480Q8WV37 535 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLG3Q92796 817 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TLK1Q9UKI8 766 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX24Q9Y343 169 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms