RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CARFQ8N187 725 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 DENND1AQ8TEH3 1009 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC74BQ96LY2 380 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IL17FQ96PD4 163 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 NRTNQ99748 197 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EPN3Q9H201 632 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS11Q9H270 941 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 POMT2Q9UKY4 750 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TLCD2A6NGC4 264 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TK2O00142 265 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RASSF9O75901 435 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD34CP0C6C1 535 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 COL6A2P12110 1019 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MPSTP25325 297 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PNLIPRP1P54315 467 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PHKG1Q16816 387 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TTMPQ5BVD1 217 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SNAP47Q5SQN1 464 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SBSNQ6UWP8 590 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01555Q8NAE3 123 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SMPDL3AQ92484 453 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1191Q96A73 305 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA5BQ9P283 1151 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL3Q9UH77 587 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IKZF3Q9UKT9 509 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 OARD1Q9Y530 152 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ISM1B1AKI9 464 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL2O95198 593 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FKBP9O95302 570 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC16A8O95907 504 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLCO1A2P46721 670 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CDKL1Q00532 357 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KLC3Q6P597 504 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LSMEM2Q8N112 164 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2W6PQ8NHA6 318 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ACMSDQ8TDX5 336 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ATL1Q8WXF7 558 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2A14Q96R47 310 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CMKLR1Q99788 373 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM109Q9BVC6 243 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL15Q9NXU5 204 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TBK1Q9UHD2 729 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PLAAQ9Y263 795 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMA5O15230 3695 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC187A0A096LP49 1063 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT87PA6NCN2 255 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM23A6NLE4 172 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MU76 341 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RFPL1O75677 317 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MT-ND3P03897 115 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT2B7P16662 529 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH3P22223 829 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1CAP62136 330 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 DLG1Q12959 904 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ACAP2Q15057 778 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC5A12Q1EHB4 618 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SPESP1Q6UW49 350 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ISCA2Q86U28 154 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KMT5CQ86Y97 462 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GPSM1Q86YR5 675 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SYTL1Q8IYJ3 562 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 AGBL5Q8NDL9 886 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF480Q8WV37 535 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL6Q8WZ60 621 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXL8Q96CD0 374 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms