RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443634.1

SNRPBP1-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SNRPBP1, Length 282 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP1-201ENST00000443634 CACNA1BQ00975 2339 aa6.51□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SPTBN2O15020 2390 aa6.51□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 RP1P56715 2156 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 URADA6NGE7 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SMIM23A6NLE4 172 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 E7EQ34 232 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 STMND1H3BQB6 276 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 STK16O75716 305 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PIAS1O75925 651 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 FAM155BO75949 473 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 KLHL2O95198 593 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SLC16A8O95907 504 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 C2P06681 752 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 TFEBP19484 476 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 AGXTP21549 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ECHS1P30084 290 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SLC5A2P31639 672 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CSF2RBP32927 897 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CCR8P51685 355 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ARSFP54793 590 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CLDN6P56747 220 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 VSNL1P62760 191 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ASPHQ12797 758 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 BMPR2Q13873 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 NDUFA9Q16795 377 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CEP97Q8IW35 865 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 KRT78Q8N1N4 520 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 D2HGDHQ8N465 521 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SNX31Q8N9S9 440 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CCDC63Q8NA47 563 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CAVIN3Q969G5 261 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 UBE2E3Q969T4 207 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CCDC126Q96EE4 140 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 THAP11Q96EK4 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 VPS50Q96JG6 964 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 IL17FQ96PD4 163 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 OR2A14Q96R47 310 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SLC30A3Q99726 388 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 NDC1Q9BTX1 674 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 DPH1Q9BZG8 443 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CENPHQ9H3R5 247 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 OGFRQ9NZT2 677 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 TBK1Q9UHD2 729 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 TAC3Q9UHF0 121 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 LRP4O75096 1905 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.5□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZZEF1O43149 2961 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CCDC151A5D8V7 595 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 C9J4A7 227 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 E7ENX8 843 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 CDC7O00311 574 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 COPEO14579 308 aa6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNRPBP1-201ENST00000443634 BRINP1O60477 761 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms