RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 U3KQA8 63 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 LAMA1P25391 3075 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 PIPSLA2A3N6 862 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 UBXN7O94888 489 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 WDR47O94967 919 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 FGF4P08620 206 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 EBLN1P0CF75 366 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CDK4P11802 303 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 NEFHP12036 1026 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CD59P13987 128 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 NPPBP16860 134 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CKMT2P17540 419 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ACP1P24666 158 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CAPZBP47756 277 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 AGTR2P50052 363 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ILKQ13418 452 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 GTF2H2Q13888 395 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC6Q16204 474 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 LIPJQ5W064 366 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 EID2Q8N6I1 236 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 L3MBTL4Q8NA19 623 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 OR10G6Q8NH81 332 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 GRAMD1AQ96CP6 724 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 C7orf26Q96N11 449 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SARGQ9BW04 601 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 GIPC1O14908 333 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 TNFSF14O43557 240 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 DUX1O43812 170 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 CBFA2T3O75081 653 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 WFS1O76024 890 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ESRRBO95718 433 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ENO1P06733 434 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 PROS1P07225 676 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 BGNP21810 368 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 CXCR2P25025 360 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 GSTM2P28161 218 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 HNF4AP41235 474 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 SLC1A6P48664 564 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 OCRLQ01968 901 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 NHLH1Q02575 133 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 BST1Q10588 318 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 LAPTM5Q13571 262 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ICE2Q659A1 982 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ATG9BQ674R7 924 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 GLRX5Q86SX6 157 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 C17orf64Q86WR6 236 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 MED8Q96G25 268 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 FAR2Q96K12 515 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 OR4K3Q96R72 315 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 CCT7Q99832 543 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 NT5DC2Q9H857 520 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 IPPKQ9H8X2 491 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 PELI2Q9HAT8 420 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 POMT2Q9UKY4 750 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-215ENST00000427487 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms