RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.37■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PPV9 198 aa16.37■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM38O00635 465 aa16.37■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC24CP53992 1094 aa16.37■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTR8Q9H981 624 aa16.37■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR6C74A6NCV1 312 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MATN2O00339 956 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZW10O43264 779 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NR1D2Q14995 579 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C17orf64Q86WR6 236 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OOSP2Q86WS3 158 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EID2Q8N6I1 236 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEIL2Q969S2 332 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAR2Q96K12 515 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.36■□□□□ 0.21
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.36■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5K3A6NET4 321 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf74A8MZ97 194 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ISM1B1AKI9 464 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLEC6O43699 453 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBXN7O94888 489 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 UROSP10746 265 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HRH2P25021 359 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPSTP25325 297 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASP2P42575 452 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRK6P43250 576 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBX1P83916 185 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRF8Q02556 426 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPEM2Q0P670 501 aa16.35■□□□□ 0.21
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