RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF21BQ96EK2 531 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FBRSQ9HAH7 460 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PADI4Q9UM07 663 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC42Q9Y546 428 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPB11Q9Y547 144 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A096LPK6 155 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RCCD1A6NED2 376 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 B8ZZF3 427 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LILRB3O75022 631 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AVILO75366 819 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LATS1O95835 1130 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNA17P01571 189 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEA3P43357 314 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CXCR3P49682 368 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IL18Q14116 193 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GNA13Q14344 377 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MYLK3Q32MK0 819 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 XKR4Q5GH76 650 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C22orf39Q6P5X5 142 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AMIGO1Q86WK6 493 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf64Q86WR6 236 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PLD5Q8N7P1 536 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM47BQ8NA70 645 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL21AQ8WXB1 218 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEC14L1Q92503 715 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FIG4Q92562 907 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NACC2Q96BF6 587 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PIGVQ9NUD9 493 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CD84Q9UIB8 345 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 E2F3O00716 465 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC30A4O14863 429 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC22A1O15245 554 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SGTAO43765 313 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT2B11O75310 529 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ITGA10O75578 1167 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CBX6O95503 412 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRAMEF1O95521 474 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SBK2P0C263 348 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 COX7A2P14406 83 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MYOGP15173 224 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFS1P28331 727 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ALDH4A1P30038 563 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DPP6P42658 865 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACTR3P61158 418 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CACNG1Q06432 222 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CBLBQ13191 982 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 BMPR2Q13873 1038 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GALNTL6Q49A17 601 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ARCQ7LC44 396 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VN1R2Q8NFZ6 395 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PMM1Q92871 262 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CERS2Q96G23 380 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR174Q9BXC1 333 aa4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms