RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 LRRC58Q96CX6 371 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 SLC35A5Q9BS91 424 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 A0A0U1RQF3 1178 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 MERTKQ12866 999 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 DSC3Q14574 896 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CHRNA6Q15825 494 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 OGFOD2Q6N063 350 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 TWNKQ96RR1 684 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 MNTQ99583 582 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 NAPRTQ6XQN6 538 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 FBXL18Q96ME1 805 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CGREF1Q99674 301 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 FAM53CQ9NYF3 392 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 GSTT2BP0CG30 244 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CLUP10909 449 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 NRG3P56975 720 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 LRRTM4Q86VH4 590 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 SNTG1Q9NSN8 517 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 GIN1Q9NXP7 522 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 FZD4Q9ULV1 537 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-204ENST00000400183 ARVCFO00192 962 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 GNB5O14775 395 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 CHP2O43745 196 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 GNSP15586 552 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 XKP51811 444 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 PITPNAQ00169 270 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 CCL14Q16627 93 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 COQ8BQ96D53 544 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ZFP3Q96NJ6 502 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 MGAT4AQ9UM21 535 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 Q9Y3F1 56 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ATRNL1Q5VV63 1379 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 S100A6P06703 90 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ADAM17P78536 824 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 LGI4Q8N135 537 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 LGR4Q9BXB1 951 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 TBX10O75333 385 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 CAPN15O75808 1086 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 LINGO3P0C6S8 592 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ZNF12P17014 697 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 GHRHRQ02643 423 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 12.5
USP25-204ENST00000400183 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 IDNKQ5T6J7 187 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 SMPDL3BQ92485 455 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 RNF39Q9H2S5 420 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 HS3ST4Q9Y661 456 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 EFCAB9A8MZ26 197 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 CBSLP0DN79 551 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ADH5P11766 374 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 CBSP35520 551 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 NRLP54845 237 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 TLE2Q04725 743 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 KCNJ11Q14654 390 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 GFOD2Q3B7J2 385 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ANO7Q6IWH7 933 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 TSTD1Q8NFU3 115 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 SMPDL3AQ92484 453 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 MARCH7Q9H992 704 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 FKBP7Q9Y680 259 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 ENGP17813 658 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 VIPR1P32241 457 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-204ENST00000400183 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms