RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 OR52E1Q8NGJ3 308 aa23.77■■□□□ 1.4
ECHDC3-201ENST00000379215 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.77■■□□□ 1.4
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC61Q9BV99 259 aa23.77■■□□□ 1.4
ECHDC3-201ENST00000379215 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1B0GTW7 788 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC22A2O15244 555 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 NPPBP16860 134 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 E2F2Q14209 437 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF542PQ5EBM4 170 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 PAGE2BQ5JRK9 111 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 IL27RAQ6UWB1 636 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC5A11Q8WWX8 675 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 WDR34Q96EX3 536 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 IL17FQ96PD4 163 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 EFCAB11Q9BUY7 163 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TUBB1Q9H4B7 451 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ELOVL6Q9H5J4 265 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SAR1AQ9NR31 198 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 BTRCQ9Y297 605 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 EML5Q05BV3 1969 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 E7EQ34 232 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC28A1O00337 649 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LAPTM5Q13571 262 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 KRT72Q14CN4 511 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ATG9BQ674R7 924 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 FBXL6Q8N531 539 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 USP7Q93009 1102 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TUBGCP3Q96CW5 907 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 REPS1Q96D71 796 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 MANBAO00462 879 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP5HO75947 161 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 EML2O95834 649 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LINC00032P0C843 101 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 DPP6P42658 865 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TCEA2Q15560 299 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 GALNTL6Q49A17 601 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LAYNQ6UX15 382 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 UBE2E3Q969T4 207 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 H0YIV9 168 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 RGS14O43566 566 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 UBOX5O94941 541 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 VIPP01282 170 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LBPP18428 481 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC19A1P41440 591 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 DOC2AQ14183 400 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIM46Q7Z4K8 759 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TMPRSS11BQ86T26 416 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 C17orf64Q86WR6 236 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 NEIL2Q969S2 332 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 AKTIPQ9H8T0 292 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ICKQ9UPZ9 632 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SERTM1A2A2V5 107 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 UBDO15205 165 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNDBP1O95273 360 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 PLK5Q496M5 336 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 FRG2Q64ET8 278 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 OGFOD2Q6N063 350 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 CHSY3Q70JA7 882 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 LCN9Q8WX39 176 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 C3orf30Q96M34 536 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 FRG2BQ96QU4 278 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM221BA6H8Z2 402 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 FFAR3O14843 346 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR42O15529 346 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 CXCR2P25025 360 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SMU1Q2TAY7 513 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
ECHDC3-201ENST00000379215 NXPE4Q6UWF7 544 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms