RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 STK16O75716 305 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 KCNK2O95069 426 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TRBC1P01850 177 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 EBLN1P0CF75 366 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CXCR2P25025 360 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 E2F2Q14209 437 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 VEPH1Q14D04 833 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 C6orf141Q5SZD1 244 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GPRC6AQ5T6X5 926 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD34AQ69YU3 496 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SUSD1Q6UWL2 747 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 MSRB3Q8IXL7 192 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PIK3C3Q8NEB9 887 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ARPC5LQ9BPX5 153 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 BTBD2Q9BX70 525 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TNKS2Q9H2K2 1166 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NEK6Q9HC98 313 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 FAM118AQ9NWS6 357 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 YIPF1Q9Y548 306 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 BNIP3LO60238 219 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RFPL2O75678 378 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SCELO95171 688 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GSNP06396 782 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CHRNB1P11230 501 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SPNP16150 400 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PCMT1P22061 227 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SP3Q02447 781 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CDC20Q12834 499 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RUNDC3AQ59EK9 446 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2UQ5VVX9 321 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RETSATQ6NUM9 610 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 EXD2Q9NVH0 621 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf109Q9NX04 203 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HTTP42858 3142 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TET1Q8NFU7 2136 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PRRG1O14668 218 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HS6ST1O60243 411 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 WDR47O94967 919 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GABARAPO95166 117 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DLGAP3O95886 979 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HPRP00739 348 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 BCKDHAP12694 445 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PRKACGP22612 351 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PIGAP37287 484 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SPAM1P38567 509 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SEPHS1P49903 392 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DGUOKQ16854 277 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TTLL9Q3SXZ7 439 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM46Q7Z4K8 759 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 MICU2Q8IYU8 434 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TP53INP1Q96A56 240 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DACH2Q96NX9 599 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NTMT1Q9BV86 223 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CLMPQ9H6B4 373 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ARL15Q9NXU5 204 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D14Q9P2M4 693 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DKK3Q9UBP4 350 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SNX5Q9Y5X3 404 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.84□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 TTC34A8MYJ7 566 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CREG1O75629 220 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CLDN9O95484 217 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 KRT6AP02538 564 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 KRT6BP04259 564 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ANXA5P08758 320 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ITIH1P19827 911 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 FSHRP23945 695 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CASP3P42574 277 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 KRT6CP48668 564 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 VAC14Q08AM6 782 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PON2Q15165 354 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LAIR2Q6ISS4 152 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD46Q86W74 232 aa12.83□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms