RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP5A6NIR3 686 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CENPXA8MT69 81 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 H0Y858 1186 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CCNKO75909 580 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HTR1AP08908 422 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ODC1P11926 461 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CD1DP15813 335 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IL7RP16871 459 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA5P22460 613 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FDXRP22570 491 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HRH2P25021 359 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SOX6P35712 828 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CASP3P42574 277 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CXCR3P49682 368 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PLK1P53350 603 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CDH13P55290 713 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GNG2P59768 71 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35A2P78381 396 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IL5RAQ01344 420 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNEQ04844 493 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KCNAB2Q13303 367 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CDK5R2Q13319 367 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OLIG2Q13516 323 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CLCA4Q14CN2 919 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.291e-10■■□□□ 12.3
CTPS1-201ENST00000372616 MEP1AQ16819 746 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 UPP1Q16831 310 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IMPG1Q17R60 797 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LRIT3Q3SXY7 679 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 XKR7Q5GH72 579 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RABL3Q5HYI8 236 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 METTL23Q86XA0 190 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PAF1Q8N7H5 531 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FLCNQ8NFG4 579 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T12Q8NG77 320 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GPR150Q8NGU9 434 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TP53INP1Q96A56 240 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf30Q96M34 536 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DERL2Q9GZP9 239 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MARCH7Q9H992 704 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TLR9Q9NR96 1032 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DDIT4Q9NX09 232 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.02□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PTGES3LE9PB15 166 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD11O00231 422 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PLK4O00444 970 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HAT1O14929 419 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 B4GAT1O43505 415 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HS6ST1O60243 411 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DFNA5O60443 496 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LILRB5O75023 590 aa7.01□□□□□ -1.29
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CTPS1-201ENST00000372616 ALX3O95076 343 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C1RP00736 705 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 POMCP01189 267 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NCK1P16333 377 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CHRM3P20309 590 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 AKT1P31749 480 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ETV6P41212 452 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PPP3CCP48454 512 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RENBPP51606 427 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CLCNKBP51801 687 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GRB7Q14451 532 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FUT11Q495W5 492 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A19Q695T7 634 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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