RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 ZBTB6Q15916 424 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ALFQ53S48 1182 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CHPFQ8IZ52 775 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 RBFAQ8N0V3 343 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 EFHBQ8N7U6 833 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 REPS2Q8NFH8 660 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 OR10A6Q8NH74 314 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ITCHQ96J02 903 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SAMD11Q96NU1 681 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CITED4Q96RK1 184 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 TRIB3Q96RU7 358 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 OSER1Q9NX31 292 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 GLTPQ9NZD2 209 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CMAHPQ9Y471 501 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.26□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ASB14A6NK59 587 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 M0R082 166 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 RFPL3O75679 317 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 HLA-DQB1P01920 261 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 GAAP10253 952 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PSKH1P11801 424 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PRPS2P11908 318 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ODC1P11926 461 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 HLA-DPA1P20036 260 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 F8A1P23610 371 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 EDNRBP24530 442 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 GGT2P36268 569 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 KCNC1P48547 511 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PIK3CGP48736 1102 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 BACE1P56817 501 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 RAB14P61106 215 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 BTG1P62324 171 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 GPLD1P80108 840 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 S100A12P80511 92 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SP2Q02086 613 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF33BQ06732 778 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PIGFQ07326 219 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 KCNC3Q14003 757 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 IRF3Q14653 427 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
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GABPB2-201ENST00000368916 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 HACD4Q5VWC8 232 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 AHSA2Q719I0 299 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ASPGQ86U10 573 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ABI1Q8IZP0 508 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 CPA6Q8N4T0 437 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 FRS2Q8WU20 508 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SGCDQ92629 289 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 C8orf48Q96LL4 319 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PPM1MQ96MI6 270 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PCYT2Q99447 389 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 APOL2Q9BQE5 337 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 MED18Q9BUE0 208 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 DPY30Q9C005 99 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SRRQ9GZT4 340 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SIK2Q9H0K1 926 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ACSS2Q9NR19 701 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 PIGVQ9NUD9 493 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GABPB2-201ENST00000368916 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.25□□□□□ -1.25
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