RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BRINP1O60477 761 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG7O75391 227 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SEC22BO75396 215 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SSTR1P30872 391 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SOX11P35716 441 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CTSCP53634 463 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ILKQ13418 452 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF276Q8N554 614 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO25Q8TCJ0 367 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 RSC1A1Q92681 617 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CERS2Q96G23 380 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DGAT2Q96PD7 388 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AGAP2Q99490 1192 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ADAP2Q9NPF8 381 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 A0A096LPK6 155 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM92AA1XBS5 289 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 A8MVJ9 347 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN14A8MX76 684 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 I3L1I5 382 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FCHO1O14526 889 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TPP1O14773 563 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AP1G1O43747 822 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ADRB1P08588 477 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 CD9P21926 228 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 ZXDBP98169 803 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CHIT1Q13231 466 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RCAN2Q14206 197 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 CYP1B1Q16678 543 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 WDR93Q6P2C0 686 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM71BQ8TC56 605 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FBF1Q8TES7 1133 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TSGA13Q96PP4 275 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL26Q9NPH9 171 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EQTNQ9NQ60 294 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 HPF1Q9NWY4 346 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LHX3Q9UBR4 397 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BTN3A3O00478 584 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA12O60330 932 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DPM1O60762 260 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RFPL1O75677 317 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PIAS1O75925 651 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM87AP0C7U9 286 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NMBRP28336 390 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL12BP29460 328 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC19A1P41440 591 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PTGIRP43119 386 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LSSP48449 732 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RHDQ02161 417 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CFHR1Q03591 330 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAP7Q14244 749 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PGS1Q32NB8 556 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM198Q66K66 360 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A4Q6AI14 798 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EMBQ6PCB8 327 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.3□□□□□ -1.72
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