RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344770.6

PDZK1-201, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PDZK1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-201ENST00000344770 COG4Q9H9E3 785 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GDE1Q9NZC3 331 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 BTBD17A6NE02 478 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MYMKA6NI61 221 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MARCH11A6NNE9 402 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C22orf46C9J442 243 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FAM86B1E9PN63 330 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 J3QRK9 145 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GMDSO60547 372 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 LPXNO60711 386 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 OR7A10O76100 309 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CSF2P04141 144 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 UGT2B4P06133 528 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PLA2G4BP0C869 781 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CSH1P0DML2 217 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CSH2P0DML3 217 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 LCN1P31025 176 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NAMPTP43490 491 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 KCNJ1P48048 391 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SELENOVP59797 346 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SLC25A3Q00325 362 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 LCP2Q13094 533 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZBTB33Q86T24 672 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 WDR48Q8TAF3 677 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MZB1Q8WU39 189 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FBXL8Q96CD0 374 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SERAC1Q96JX3 654 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DERL2Q9GZP9 239 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ASB8Q9H765 288 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SCN5AQ14524 2016 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 A0A1W2PPM1 405 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 H0Y8G0 127 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RHBDL1O75783 438 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CRYGCP07315 174 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TUBG1P23258 451 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MSX1P28360 303 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ACTR1BP42025 376 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SLC1A3P43003 542 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RABGGTBP53611 331 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ACTR2P61160 394 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GPC5P78333 572 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TRAF2Q12933 501 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GK3PQ14409 553 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 INAVAQ3KP66 663 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FGD3Q5JSP0 725 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TRILQ7L0X0 811 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MON1AQ86VX9 555 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TMEM80Q96HE8 168 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RTKNQ9BST9 563 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms