RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TMC8Q8IU68 726 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CPXM2Q8N436 756 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FRS2Q8WU20 508 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SCAMP4Q969E2 229 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LMLNQ96KR4 655 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ASIC5Q9NY37 505 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SDC1P18827 310 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MATN1P21941 496 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 S100A1P23297 94 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PTPN6P29350 595 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GZMMP51124 257 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN8P56748 225 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PIGFQ07326 219 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZVU0 165 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM25Q86YD3 366 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NAT16Q8N8M0 369 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ASB11Q8WXH4 323 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 STARD8Q92502 1023 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 APOLD1Q96LR9 279 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 EBPLQ9BY08 206 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FANCEQ9HB96 536 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 EXD2Q9NVH0 621 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SCELO95171 688 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CBSLP0DN79 551 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CBSP35520 551 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC7A9P82251 487 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PPP2R2BQ00005 443 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MEP1AQ16819 746 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MPP7Q5T2T1 576 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GPR149Q86SP6 731 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PLPP6Q8IY26 295 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SIX5Q8N196 739 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SH3GL1Q99961 368 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 BBS2Q9BXC9 721 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR56A5P0C7T3 313 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DCKP27707 260 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPINT3P49223 89 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KCNH6Q9H252 994 aa15.91■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PFKLP17858 780 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HIST1H2ADP20671 130 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KCNAB2Q13303 367 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPIDRQ14159 915 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LAPTM4AQ15012 233 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CES5AQ6NT32 575 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF773Q6PK81 442 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT10Q86SR1 603 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FOXJ1Q92949 421 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CEP44Q9C0F1 390 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MYO7AQ13402 2215 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HS6ST1O60243 411 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC6A12P48065 614 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NRIP1P48552 1158 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NUP107P57740 925 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 VAC14Q08AM6 782 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ATG9BQ674R7 924 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ITCHQ96J02 903 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SNX6Q9UNH7 406 aa15.9■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 A0A096LPI6 279 aa15.89■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.89■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ERN1O75460 977 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 AGXTP21549 392 aa15.89■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CDH3P22223 829 aa15.89■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CRHBPP24387 322 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms