RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OSER1Q9NX31 292 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OARD1Q9Y530 152 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 G6PDP11413 515 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 HLA-EP13747 358 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PIK3CBP42338 1070 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GSK3BP49841 420 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GLYATL1Q969I3 302 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM25AB3EWG3 89 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM25CB3EWG5 89 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM25GB3EWG6 89 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DGKQP52824 942 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DSC1Q08554 894 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 HKDC1Q2TB90 917 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 UNC50Q53HI1 259 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 IRGMA1A4Y4 181 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 A6NHS1 94 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CLIC1O00299 241 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 STX11O75558 287 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NT5EP21589 574 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PTSQ03393 145 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC32Q14392 662 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 RGMAQ96B86 450 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TGFB1P01137 390 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PGRP06401 933 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CAPGP40121 348 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 AGTR2P50052 363 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OLR1P78380 273 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ARMC4Q5T2S8 1044 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 APCDD1Q8J025 514 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF347Q96SE7 839 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 RHDQ02161 417 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CREB5Q02930 508 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM129CQ86XR2 697 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OXR1Q8N573 874 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SLC9A6Q92581 669 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SCAMP4Q969E2 229 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PERM1Q5SV97 790 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DCST1Q5T197 706 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 K7ERQ8 282 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 NDUFB5O43674 189 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 NR2F6P10588 404 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 SUOXP51687 545 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 EOGTQ5NDL2 527 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 HOXB2P14652 356 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 ETV4P43268 484 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 SMARCD2Q92925 531 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 SLC38A4Q969I6 547 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-202ENST00000320031 CD320Q9NPF0 282 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms