RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 LINGO1Q96FE5 620 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 CALML4Q96GE6 196 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ST6GAL2Q96JF0 529 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ART5Q96L15 291 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ACOX2Q99424 681 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NEURL2Q9BR09 285 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NFKBIZQ9BYH8 718 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 XKR8Q9H6D3 395 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ANO10Q9NW15 660 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 MORF4L1Q9UBU8 362 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 FBXL2Q9UKC9 423 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA1257Q9ULG3 409 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 AURKCQ9UQB9 309 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 GMEB1Q9Y692 573 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 CAPN7Q9Y6W3 813 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ROCK1Q13464 1354 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 OR6C74A6NCV1 312 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 GOLGA6L10A6NI86 522 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ACOD1A6NK06 481 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NDUFS8O00217 210 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 RNF103O00237 685 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NVLO15381 856 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 KRT34O76011 436 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 GCNT3O95395 438 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 SCGB1D1O95968 90 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 F9P00740 461 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 FAM106CPP0CH98 169 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 UBL4AP11441 157 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NR1D1P20393 614 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ANXA13P27216 316 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 RPL9P32969 192 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 GP5P40197 560 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 FNTAP49354 379 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 DSTNP60981 165 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ARF5P84085 180 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 EPS8Q12929 822 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 RPA4Q13156 261 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.955e-9■■■■□ 25.9
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC6Q16204 474 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 FAM173BQ6P4H8 233 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ISLR2Q6UXK2 745 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ERO1BQ86YB8 467 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 CD302Q8IX05 232 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 XXYLT1Q8NBI6 393 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 APBB2Q92870 758 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 TAAR8Q969N4 342 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 SGK3Q96BR1 496 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF524Q96C55 264 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 SAAL1Q96ER3 474 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 SGF29Q96ES7 293 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ITPAQ9BY32 194 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 OPA3Q9H6K4 179 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 BRF2Q9HAW0 419 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ASAH2Q9NR71 780 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 SLC35D1Q9NTN3 355 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 AMACRQ9UHK6 382 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 HAO1Q9UJM8 370 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 CCL27Q9Y4X3 112 aa2.89□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ANTXRLA6NF34 631 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 PGRMC2O15173 223 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ZW10O43264 779 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 ATP8B1O43520 1251 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 BUB1O43683 1085 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 CYTH3O43739 400 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 EXTL3O43909 919 aa2.88□□□□□ -1.95
GPBP1-201ENST00000264779 FLOT1O75955 427 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms