RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PANX1Q96RD7 426 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 IL21Q9HBE4 155 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C1orf109Q9NX04 203 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RHCGQ9UBD6 479 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OARD1Q9Y530 152 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TTC34A8MYJ7 566 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FAM227AF5H4B4 570 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PFDN6O15212 129 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ENGP17813 658 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SPAM1P38567 509 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RAD23AP54725 363 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NCS1P62166 190 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NAE1Q13564 534 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 VEPH1Q14D04 833 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CYP2A13Q16696 494 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C5orf22Q49AR2 442 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GPR153Q6NV75 609 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 USP51Q70EK9 711 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PDPRQ8NCN5 879 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 COPS8Q99627 209 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BRD9Q9H8M2 597 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C1SP09871 688 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OPRL1P41146 370 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CLCN4P51793 760 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 IRF5Q13568 498 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DNASE1L3Q13609 305 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TP53BP2Q13625 1128 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 XKR6Q5GH73 641 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MICU2Q8IYU8 434 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PEX13Q92968 403 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C5AR2Q9P296 337 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TGM5O43548 720 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FUCA1P04066 466 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 LCKP06239 509 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PSMB9P28065 219 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CSNK1DP48730 415 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HLCSP50747 726 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CRISP3P54108 245 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GRIN2CQ14957 1233 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NUMA1Q14980 2115 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMEM215Q68D42 235 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RETSATQ6NUM9 610 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C11orf74Q86VG3 221 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PROSER1Q86XN7 944 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DPP10Q8N608 796 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SMYD1Q8NB12 490 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 KCNC2Q96PR1 638 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CLMPQ9H6B4 373 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMCO1Q9UM00 188 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TRIM17Q9Y577 477 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 A8MU76 341 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 J3KTA2 159 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 K7ESM1 405 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FPGTO14772 594 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms