RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 CLCN2P51788 898 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 BTN3A2P78410 334 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 PPM1JQ5JR12 505 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ADGRF1Q5T601 910 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SMPDL3AQ92484 453 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 OTUB2Q96DC9 234 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 OR2AG1Q9H205 316 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MLXQ9UH92 298 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 WASF3Q9UPY6 502 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GSRP00390 522 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 EBLN1P0CF75 366 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ELNP15502 786 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TMEM110Q86TL2 294 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GPR151Q8TDV0 419 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 C10orf82Q8WW14 230 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 KCTD7Q96MP8 289 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MYOCQ99972 504 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ASPNQ9BXN1 380 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 GIN1Q9NXP7 522 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ARL5AQ9Y689 179 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 CAPN8A6NHC0 703 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SCDO00767 359 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ZNF432O94892 652 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SUOXP51687 545 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 CBX3Q13185 183 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 BBS10Q8TAM1 723 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TFAP2BQ92481 460 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 KAT2AQ92830 837 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 CAPNS2Q96L46 248 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 FAM129BQ96TA1 746 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ITPAQ9BY32 194 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 INSL6Q9Y581 213 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC19A2O60779 497 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 LATS1O95835 1130 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DQB2P05538 268 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MAP3K8P41279 467 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ENPP2Q13822 863 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MBLAC2Q68D91 279 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 LINGO2Q7L985 606 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SETD6Q8TBK2 473 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 PEX13Q92968 403 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MFSD3Q96ES6 412 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 COPS4Q9BT78 406 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MANBAO00462 879 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 DCLK1O15075 740 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 CD48P09326 243 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 AQP1P29972 269 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MAGEA2P43356 314 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 CBLBQ13191 982 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 MYLK3Q32MK0 819 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 TMIEQ8NEW7 156 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 OR2L3Q8NG85 312 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.05□□□□□ -1.28
CPS1-201ENST00000233072 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms