RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PDGFAP04085 211 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CHRM3P20309 590 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FOLR3P41439 243 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TERF1P54274 439 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GBX1Q14549 363 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NAA25Q14CX7 972 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NFS1Q9Y697 457 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MED13Q9UHV7 2174 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 E5RI56 91 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PEX12O00623 359 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZSCAN12O43309 604 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 KLHL41O60662 606 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NIPSNAP2O75323 286 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MATN4O95460 622 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CTSBP07858 339 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 OTX2P32243 289 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 BDKRB1P46663 353 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP1A4Q13733 1029 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GRM7Q14831 915 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FCRL6Q6DN72 434 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CNSTQ6PJW8 725 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CENPUQ71F23 418 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MRGPREQ86SM8 312 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ATCAYQ86WG3 371 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PTERQ96BW5 349 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MS4A14Q96JA4 679 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SERPINB12Q96P63 405 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FLNCQ14315 2725 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1B0GX78 115 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 DPM1O60762 260 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ONECUT2O95948 504 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ALBP02768 609 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ALAS2P22557 587 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 HSD17B2P37059 387 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GRIA3P42263 894 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GCGRP47871 477 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FNTAP49354 379 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 IGFBP7Q16270 282 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CYP2A13Q16696 494 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CALML6Q8TD86 181 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MIB2Q96AX9 1013 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FKBP10Q96AY3 582 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NACC2Q96BF6 587 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR83Q9NYM4 423 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PTPN13Q12923 2485 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRK2Q5S007 2527 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CTAGE9A4FU28 777 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF839A8K0R7 811 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CES2O00748 559 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 DSCR3O14972 297 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF185O15231 689 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PHF2O75151 1096 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 USP1O94782 785 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CATP04040 527 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGEA3P43357 314 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CD97P48960 835 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms