RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ACVR2A	P27037	513 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HTR1E	P28566	365 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAPK8	P45983	427 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP7	Q16829	419 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CUZD1	Q86UP6	607 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MIER2	Q8N344	545 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SVOPL	Q8N434	492 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EFHB	Q8N7U6	833 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PJA1	Q8NG27	643 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC58	Q96CX6	371 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MYO19	Q96H55	970 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ASB2	Q96Q27	587 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC30A3	Q99726	388 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CMTM6	Q9NX76	183 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ITM2B	Q9Y287	266 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FXYD1	O00168	92 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC1A7	O00341	560 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PGLS	O95336	258 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IGSF6	O95976	241 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NPPA	P01160	153 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CEBPB	P17676	345 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HLA-F	P30511	346 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RYK	P34925	604 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	UGT2B10	P36537	528 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DDOST	P39656	456 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BNC1	Q01954	994 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SEMA3A	Q14563	771 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RFX4	Q33E94	735 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP69	Q49AA0	526 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RETREG3	Q86VR2	466 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PLD3	Q8IV08	490 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NDNF	Q8TB73	568 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NXNL1	Q96CM4	212 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GPR78	Q96P69	363 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BBS2	Q9BXC9	721 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAP10	Q9P2G4	905 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN24	A6NM45	220 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NR5A2	O00482	541 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SRC	P12931	536 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRKACB	P22694	351 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCD	Q05655	676 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BCL2L1	Q07817	233 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GRIK2	Q13002	908 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC13A2	Q13183	592 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SHH	Q15465	462 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KIF19	Q2TAC6	998 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FUT11	Q495W5	492 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MCFD2	Q8NI22	146 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAR1	Q8WVX9	515 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ING5	Q8WYH8	240 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OTUB2	Q96DC9	234 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RUBCNL	Q9H714	662 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	POLE4	Q9NR33	117 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		14.93	□□□□□ -0.02

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