RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM39Q9HCM9 518 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SHANK1Q9Y566 2161 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 AURKAO14965 403 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CREG1O75629 220 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 RECKO95980 971 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GOT2P00505 430 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PIRTP0C851 137 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CRABP2P29373 138 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPZBP47756 277 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CTBP1Q13363 440 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DBN1Q16643 649 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TYSND1Q2T9J0 566 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CRTC3Q6UUV7 619 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ATCAYQ86WG3 371 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB18Q96M61 343 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA5BQ9P283 1151 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PKP3Q9Y446 797 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC14CA4D256 554 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PFDN6O15212 129 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 KATNA1O75449 491 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF224P0DH78 156 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DCDC1P59894 354 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1CAP62136 330 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DNASE1L3Q13609 305 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CT55Q8WUE5 264 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX15Q9NRS6 342 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPERZQ9NTU4 200 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA6Q9UF33 1036 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MED13Q9UHV7 2174 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR89AB7ZAQ6 455 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8RI6L899 631 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GLRA3O75311 464 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 VIPP01282 170 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR89BP0CG08 455 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 HHATQ5VTY9 493 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DTX3LQ8TDB6 740 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP6Q96FZ7 201 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 LHX9Q9NQ69 397 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 KCND3Q9UK17 655 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52A4PA6NMU1 304 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS5O94927 633 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 AMD1P17707 334 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 NELFEP18615 380 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GNLYP22749 145 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A3P40879 764 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR18Q14330 331 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 WASH2PQ6VEQ5 465 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CERS6Q6ZMG9 384 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 RASGRP3Q8IV61 690 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 GLYATL1Q969I3 302 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM29Q9BSF4 260 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TWSG1Q9GZX9 223 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 WASH6PQ9NQA3 447 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PADI1Q9ULC6 663 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MTX2O75431 263 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 C2P06681 752 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CD9P21926 228 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXN2P32314 431 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 XIAPP98170 497 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-216ENST00000628306 MPP1Q00013 466 aa23.4■■□□□ 1.34
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