RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRC5BQ9NZH0 403 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMTOR5O43504 91 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0754O94854 1291 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HMOX2P30519 316 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 BLKP51451 505 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 DMTNQ08495 405 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 NXNQ6DKJ4 435 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LAYNQ6UX15 382 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC29A3Q9BZD2 475 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR4O00206 839 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 UGDHO60701 494 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 WFS1O76024 890 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00032P0C843 101 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 NPPBP16860 134 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CCND1P24385 295 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 XKR7Q5GH72 579 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF165Q6ZSG1 346 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC106Q9BWC9 280 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 GSDMCQ9BYG8 508 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PFDN4Q9NQP4 134 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMCX1Q9P291 453 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA7Q8IZY2 2146 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF839A8K0R7 811 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6AP2O75787 350 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 F3P13726 295 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR6P50406 440 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 BNIP1Q12981 228 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CHIT1Q13231 466 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR45BQ5MNZ6 344 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPJQ5W064 366 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SUSD1Q6UWL2 747 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LONP2Q86WA8 852 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf210Q8IVY1 113 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 NRTNQ99748 197 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MIPEPQ99797 713 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 AKTIPQ9H8T0 292 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 FANCMQ8IYD8 2048 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN14A8MX76 684 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 E7EQ34 232 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CLGNO14967 610 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 GNAZP19086 355 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF8Q02556 426 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 E2F2Q14209 437 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT33BQ14525 404 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CHSY3Q70JA7 882 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF385DQ9H6B1 395 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 FFAR3O14843 346 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR42O15529 346 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS4BO75351 444 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CSF2P04141 144 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSEP14091 401 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 JUNDP17535 347 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFS1P28331 727 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP2P42575 452 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT72Q14CN4 511 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ABRAXAS2Q15018 415 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM198Q66K66 360 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SCIMPQ6UWF3 145 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LCTLQ6UWM7 567 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM105Q8N8V8 129 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52E1Q8NGJ3 308 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGCLL1Q8TB92 370 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 USP7Q93009 1102 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 NEIL2Q969S2 332 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TAAR2Q9P1P5 351 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MANBAO00462 879 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR35P0CG20 571 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 JUPP14923 745 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB28P51157 221 aa24.08■■□□□ 1.45
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