RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT13Q86X67 352 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 POC5Q8NA72 575 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 KAT2AQ92830 837 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TAC3Q9UHF0 121 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PITPNM1O00562 1244 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX28O15482 410 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PGGT1BP53609 377 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD9AQ99638 391 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MTRRQ9UBK8 725 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 NOBOXO60393 691 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 G6PDP11413 515 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 BLKP51451 505 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 LMAN2Q12907 356 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 NAT14Q8WUY8 206 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CALML5Q9NZT1 146 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ARPC2O15144 300 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 NFATC2Q13469 925 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 DDI2Q5TDH0 399 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM110BQ8TC76 370 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MCIDASD6RGH6 385 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TPST2O60704 377 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 SYT11Q9BT88 431 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MYH7P12883 1935 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 GSK3BP49841 420 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 S100A13Q99584 98 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CITO14578 2027 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MANBAO00462 879 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPGP40121 348 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PREPP48147 710 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 AGTR2P50052 363 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 SMPDL3AQ92484 453 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 NODALQ96S42 347 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 STX16O14662 325 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNB2O95067 398 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 GADD45GO95257 159 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP11A1P05108 521 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MCFD2Q8NI22 146 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX13Q92968 403 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PP18 115 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRS7Q9Y394 339 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BNX3 289 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 B3GALT2O43825 422 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 LEFTY1O75610 366 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KLK1P06870 262 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 EBLN1P0CF75 366 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 IL7RP16871 459 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM74Q86UV6 250 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLQ8NG68 377 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 HM13Q8TCT9 377 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 HNF1BP35680 557 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJB13P59910 316 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TAB1Q15750 504 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OTUB2Q96DC9 234 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf21Q9H246 121 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE10AQ9Y233 779 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNK6Q9Y257 313 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TFPIP10646 304 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ENGP17813 658 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NR4A1P22736 598 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MYL9P24844 172 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OAZ3Q9UMX2 235 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms