RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AGLP35573 1532 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CAP2P40123 477 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA8P43361 318 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AVPR1BP47901 424 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R31P59538 309 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 VLDLRP98155 873 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FOXM1Q08050 763 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DCST2Q5T1A1 773 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 OR51E2Q9H255 320 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 A8MVJ9 347 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HCN1O60741 890 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NPPAP01160 153 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF286BP0CG31 522 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC58Q4VC31 144 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SGK2Q9HBY8 427 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SPTLC1O15269 473 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 UPP2O95045 317 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AMHP03971 560 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GOT1P17174 413 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LHCGRP22888 699 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC1A5Q15758 541 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AAK1Q2M2I8 961 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN15O95858 294 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CCNFP41002 786 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PTGR1Q14914 329 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RTL6Q6ICC9 239 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 REPS2Q8NFH8 660 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 USP29Q9HBJ7 922 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MIOSQ9NXC5 875 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPM1 405 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf78A6NCI8 922 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 IL3P08700 152 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TFPIP10646 304 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CDK3Q00526 305 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FAM83AQ86UY5 434 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LDAHQ9H6V9 325 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C20orf202A1L168 122 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RCCD1A6NED2 376 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CXCR6O00574 342 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C22orf31O95567 290 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AP2A1O95782 977 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH2P05091 517 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNB4P30926 498 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 S100A10P60903 97 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CD83Q01151 205 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MZT1Q08AG7 82 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NADK2Q4G0N4 442 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BANPQ8N9N5 519 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf82Q8WW14 230 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NCK1P16333 377 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ITPKBP27987 946 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PBX1P40424 430 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ACTC1P68032 377 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ACTA1P68133 377 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NXPE1Q8N323 547 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FAM86B1E9PN63 330 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 E2F3O00716 465 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NTSR2O95665 410 aa6.84□□□□□ -1.31
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