RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 SPOCK3Q9BQ16 436 aa20.81■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF304Q9HCX3 659 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 CST8O60676 142 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEF2O60811 474 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 ANXA9O76027 345 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 BMP10O95393 424 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 COX6A1P12074 109 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 ACADLP28330 430 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-205ENST00000588780 EMP2P54851 167 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
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CAPNS1-205ENST00000588780 ERVK-10P10266 1014 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-205ENST00000588780 ITGAMP11215 1152 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-205ENST00000588780 ABOP16442 354 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-205ENST00000588780 AP2B1P63010 937 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-205ENST00000588780 TYRO3Q06418 890 aa20.75■□□□□ 0.91
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