RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576677.5

TBCD-222, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 1 (best)

Gene TBCD, Length 1,926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-222	ENST00000576677	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	DOK6	Q6PKX4	331 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF480	Q8WV37	535 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	LGR4	Q9BXB1	951 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	DPY30	Q9C005	99 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	BCKDHA	P12694	445 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	DOC2A	Q14183	400 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	STARD3	Q14849	445 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	AAK1	Q2M2I8	961 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TBCD-222	ENST00000576677	CLGN	O14967	610 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	DNAJA2	O60884	412 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	HNF4A	P41235	474 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	DGKQ	P52824	942 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	RHD	Q02161	417 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	BNIP2	Q12982	314 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	RPA4	Q13156	261 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	SDE2	Q6IQ49	451 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	AMZ2	Q86W34	360 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	DHFR2	Q86XF0	187 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TEX101	Q9BY14	249 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	VCX3B	Q9H321	246 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	STAMBP	O95630	424 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TEAD1	P28347	426 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	RABL3	Q5HYI8	236 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	NUDT8	Q8WV74	236 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	CLMP	Q9H6B4	373 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	WDR26	Q9H7D7	661 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	FBRS	Q9HAH7	460 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		21.32	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677		H0YIV9	168 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PRPS2	P11908	318 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	ACPP	P15309	386 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PEX2	P28328	305 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TRIM23	P36406	574 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TBPL1	P62380	186 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	E2F2	Q14209	437 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	FGL2	Q14314	439 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	INPP5A	Q14642	412 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	IRF4	Q15306	451 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TRIP10	Q15642	601 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PDZD3	Q86UT5	571 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	HID1	Q8IV36	788 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	OXR1	Q8N573	874 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	GANC	Q8TET4	914 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	NANOG	Q9H9S0	305 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	ADAM23	O75077	832 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	IL6	P05231	212 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	GPR89B	P0CG08	455 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	PCSK2	P16519	638 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	MAPK1	P28482	360 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	COL19A1	Q14993	1142 aa		21.31	■■□□□ 1
TBCD-222	ENST00000576677	LPCAT4	Q643R3	524 aa		21.31	■■□□□ 1

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