RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TTC13Q8NBP0 860 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 GRHL3Q8TE85 626 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 FKBP10Q96AY3 582 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 A0A0U1RQJ8 604 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 HEATR9A2RTY3 570 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PSMD3O43242 534 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 KDM1AO60341 852 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 MED26O95402 600 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 BDKRB1P46663 353 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ARSFP54793 590 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 RBBP7Q16576 425 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PEX26Q7Z412 305 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 LINC00523Q86TU6 105 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 KCNMB4Q86W47 210 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 OR4L1Q8NH43 312 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 WDR54Q9H977 334 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 AMFRQ9UKV5 643 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.87□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 LRRTM2O43300 516 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 CTSVO60911 334 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 GPC4O75487 556 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 Q0VFX4 171 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 CDC16Q13042 620 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 AGAP4Q96P64 663 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PANX2Q96RD6 677 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 APCP25054 2843 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 RASGRF2O14827 1237 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 S1PR4O95977 384 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 IFNB1P01574 187 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 RPN2P04844 631 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 APOA4P06727 396 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ETS1P14921 441 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 PRAMEP78395 509 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 GRM7Q14831 915 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 KIAA1328Q86T90 577 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 C8orf44Q96CB5 159 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TTC1Q99614 292 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 MIPEPQ99797 713 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 CRB3Q9BUF7 120 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 LHPPQ9H008 270 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 NFS1Q9Y697 457 aa14.85□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 A0A0J9YVX5 310 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ENO4A6NNW6 628 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 FFAR3O14843 346 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 GPR42O15529 346 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 KLHL18O94889 574 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ONECUT2O95948 504 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 GAS8O95995 478 aa14.84□□□□□ -0.03
NME3-211ENST00000568561 ALBP02768 609 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms