RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 ATL1Q8WXF7 558 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 SMPDL3AQ92484 453 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 IL17FQ96PD4 163 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 OR6C1Q96RD1 312 aa9.03□□□□□ -0.96
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CS-224ENST00000551155 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 DPH1Q9BZG8 443 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 DERL2Q9GZP9 239 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 FGF21Q9NSA1 209 aa9.03□□□□□ -0.96
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CS-224ENST00000551155 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 PDE10AQ9Y233 779 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 BTRCQ9Y297 605 aa9.03□□□□□ -0.96
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CS-224ENST00000551155 C9orf172C9J069 976 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 RIPK2O43353 540 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 PRAMEF10O60809 474 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 FAM155BO75949 473 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 CCNDBP1O95273 360 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 FAM153BP0C7A2 387 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 CCDC166P0CW27 439 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 FGF5P12034 268 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 ST6GAL1P15907 406 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 CMPK1P30085 196 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 ATP6V0D1P61421 351 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 CDKL1Q00532 357 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 TUBB3Q13509 450 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 FAM153CQ494X1 144 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 MROH9Q5TGP6 573 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 WDR93Q6P2C0 686 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 ZNF480Q8WV37 535 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.02□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.02□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.02□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 TLK1Q9UKI8 766 aa9.02□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 RARRES3Q9UL19 164 aa9.02□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 A0A087X1B8 175 aa9.01□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 STMND1H3BQB6 276 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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CS-224ENST00000551155 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-224ENST00000551155 SLC29A2Q14542 456 aa9.01□□□□□ -0.97
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