RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SSNA1O43805 119 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CDH13P55290 713 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SLC18A2Q05940 514 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 GRIK2Q13002 908 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SLC13A2Q13183 592 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DECR1Q16698 335 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf22Q49AR2 442 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 LINGO4Q6UY18 593 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 MARK1Q9P0L2 795 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 FAM92AA1XBS5 289 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SH3BGRLO75368 114 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 ACVR2AP27037 513 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SLC34A3Q8N130 599 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ELOA3Q8NG57 546 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ASB9Q96DX5 294 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 MFSD3Q96ES6 412 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 C7P10643 843 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SEC13P55735 322 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 EMX2Q04743 252 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf74A8MZ97 194 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 STC1P52823 247 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CAMK1Q14012 370 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 BNIPLQ7Z465 357 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM189A1O60320 539 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ITIH1P19827 911 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CYP4F2P78329 520 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRE1Q14246 886 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 MED22Q15528 200 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 MSANTD3Q96H12 275 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R39P59534 338 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJB5O75953 348 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ANGPTL1O95841 491 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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