RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546076.5

TSPAN11-204, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TSPAN11, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-204ENST00000546076 HPS6Q86YV9 775 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PDIK1LQ8N165 341 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ZBTB2Q8N680 514 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 BIRC8Q96P09 236 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 GPR83Q9NYM4 423 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TCFL5Q9UL49 500 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CDYLQ9Y232 598 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 S1PR4O95977 384 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 RPN2P04844 631 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TNFRSF8P28908 595 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FMO4P31512 558 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CENPUQ71F23 418 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 DSELQ8IZU8 1212 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OR8K5Q8NH50 307 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 LRRC39Q96DD0 335 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SNF8Q96H20 258 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C5orf34Q96MH7 638 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PPM1MQ96MI6 270 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 LRFN5Q96NI6 719 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KRT12Q99456 494 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 NLNQ9BYT8 704 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FAM187AA6NFU0 413 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CAPN1P07384 714 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SHMT2P34897 504 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ABRQ12979 859 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CBLBQ13191 982 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PRKG2Q13237 762 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ATP1A4Q13733 1029 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 MED25Q71SY5 747 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KRT222Q8N1A0 295 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 BBOF1Q8ND07 529 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CHRM3P20309 590 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ATP5DP30049 168 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 RORAP35398 523 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ITGA8P53708 1063 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ARL4CP56559 192 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CRYMQ14894 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 MSS51Q4VC12 460 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 VRK3Q8IV63 474 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 IQCKQ8N0W5 287 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ERP44Q9BS26 406 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms