RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ISM1B1AKI9 464 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STMND1H3BQB6 276 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RRP8O43159 456 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LIPCP11150 499 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STMN1P16949 149 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNLIPRP1P54315 467 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TUBB3Q13509 450 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST3GAL2Q16842 350 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMPDL3AQ92484 453 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCTN2Q96GX1 697 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC138Q96M89 665 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL17FQ96PD4 163 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPAMQ9HCL2 828 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.85■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCNDBP1O95273 360 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACSL3O95573 720 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC16A8O95907 504 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST6GAL1P15907 406 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAB10P61026 200 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAP7Q14244 749 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR6C1Q96RD1 312 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PKP4Q99569 1192 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NRTNQ99748 197 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DERL2Q9GZP9 239 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RARRES3Q9UL19 164 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAXQ9Y2V3 346 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.84■□□□□ 0.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAF4O00268 1085 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIAS1O75925 651 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EBLN1P0CF75 366 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIST1H2ADP20671 130 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAT1P21673 171 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCND1P24385 295 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNTFP26441 200 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CRABP2P29373 138 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC26A3P40879 764 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SH3BP2P78314 561 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXM1Q08050 763 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.127e-10■□□□□ 10.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP97Q8IW35 865 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF480Q8WV37 535 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC44A1Q8WWI5 657 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGF21Q9NSA1 209 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FETUBQ9UGM5 382 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDE10AQ9Y233 779 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LAMA5O15230 3695 aa15.83■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1W2PPV9 198 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC189A1A4V9 331 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TARM1B6A8C7 271 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 E7ENX8 843 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INHBAP08476 426 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOLR1P15328 257 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IMPA1P29218 277 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SERPINB9P50453 376 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP1A2P50993 1020 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PMS2P54278 862 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP6V0D1P61421 351 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXK1P85037 733 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDKL1Q00532 357 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAP2Q03519 686 aa15.82■□□□□ 0.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms