RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 NUP37Q8NFH4 326 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PR80 420 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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