RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ARSF	P54793	590 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CDC16	Q13042	620 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	DLG3	Q92796	817 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRBA	P50851	2863 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSMD3	O43242	534 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	KDM1A	O60341	852 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZG16	O60844	167 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSMB5	P28074	263 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CDH17	Q12864	832 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	GRM7	Q14831	915 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RBBP7	Q16576	425 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	P3H1	Q32P28	736 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LINC00523	Q86TU6	105 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LHPP	Q9H008	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129		A0A0J9YVX5	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	HYKK	A2RU49	373 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FTCD	O95954	541 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	S1PR4	O95977	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	EDN3	P14138	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ETS1	P14921	441 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	AOAH	P28039	575 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	BDKRB1	P46663	353 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ACVR1	Q04771	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	KLC1	Q07866	573 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MIPEP	Q99797	713 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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