RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517257.1

RNU6-709P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 709, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-709P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-709P-201ENST00000517257 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 CATSPER2Q96P56 530 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 IL17FQ96PD4 163 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 MIPEPQ99797 713 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HAUS8Q9BT25 410 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ARMCX1Q9P291 453 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ZNF225Q9UK10 706 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SNX6Q9UNH7 406 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 BTRCQ9Y297 605 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 KNL1Q8NG31 2342 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SDK1Q7Z5N4 2213 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 A0A1W2PR77 199 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 TMEM221A6NGB7 291 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 OR5K4A6NMS3 321 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 E7EQ34 232 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 M0R296 226 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 TLR4O00206 839 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 MANBAO00462 879 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 FFAR3O14843 346 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 UBDO15205 165 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SLC22A2O15244 555 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 GPR42O15529 346 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RGS14O43566 566 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ULK1O75385 1050 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ATP6AP2O75787 350 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ERGP11308 486 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 F3P13726 295 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SLC2A4P14672 509 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 JUPP14923 745 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 NPPBP16860 134 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 JUNDP17535 347 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 LBPP18428 481 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 EPORP19235 508 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 BCKDHBP21953 392 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 CALB2P22676 271 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 MAOBP27338 520 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HOXA6P31267 233 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HNF4AP41235 474 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SCTRP47872 440 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HTR6P50406 440 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RAB28P51157 221 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ATP4BP51164 291 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 C21orf59P57076 290 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 STX1BP61266 288 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 DMWDQ09019 674 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 BNIP1Q12981 228 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 KLF10Q13118 480 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 LAPTM5Q13571 262 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 FZD2Q14332 565 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 GRB7Q14451 532 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 SQLEQ14534 574 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 RPS6KA2Q15349 733 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 NR6A1Q15406 480 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 TCEA2Q15560 299 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 IMPG1Q17R60 797 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 KIF19Q2TAC6 998 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-709P-201ENST00000517257 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms