RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLH	Q9Y253	713 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTAGE9	A4FU28	777 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYO1C	O00159	1063 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUV39H1	O43463	412 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDM1A	O60341	852 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSV	O60911	334 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2B3	O76000	313 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVK-10	P10266	1014 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGAM1	P18669	254 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNF	P41002	786 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRIA3	P42263	894 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMS2	P54278	862 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPZ	Q66K79	652 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD200R1	Q8TD46	325 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ9	Q92806	393 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM117A	Q9C073	453 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCFL5	Q9UL49	500 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHRS7	Q9Y394	339 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCM1	Q15154	2024 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PFDN6	O15212	129 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTI1	O43156	1089 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP3K7	O43318	606 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJB5	O75953	348 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED26	O95402	600 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDGFA	P04085	211 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR1D1	P20393	614 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCM3	P25205	808 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXL2	P58012	376 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CUL1	Q13616	776 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MORF4L2	Q15014	288 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCF4	Q15080	339 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf189	Q5VU69	101 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR135	Q8IZ08	494 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2L3	Q8NG85	312 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB11	Q8WXH4	323 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLG3	Q92796	817 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOPNL	Q96NB1	174 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKP4	Q99569	1192 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR21	Q99679	349 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014		E5RI56	91 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFY	I3L273	518 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014		J3QKU1	62 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC28A2	O43868	658 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	FKBP9	O95302	570 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	AHSG	P02765	367 aa		12.19	□□□□□ -0.46

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