RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35F6Q8N357 371 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCUQ8NE86 351 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTAGE9A4FU28 777 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF185O15231 689 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOLR3P41439 243 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRADP55042 308 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXK1P85037 733 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP1B1Q16678 543 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCRL6Q6DN72 434 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPUQ71F23 418 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED25Q71SY5 747 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DLG3Q92796 817 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT87PA6NCN2 255 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A6NL46 340 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZSCAN12O43309 604 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FKBP9O95302 570 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARSFP54793 590 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP1A4Q13733 1029 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSPNQ14714 243 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COG1Q8WTW3 980 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERPINB12Q96P63 405 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIPEPQ99797 713 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GALPQ9UBC7 116 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHF2O75151 1096 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5DP30049 168 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBASA2RRP1 2371 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TARM1B6A8C7 271 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MATN4O95460 622 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMB5P28074 263 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MLLT10P55197 1068 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTBP1Q13363 440 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GBX1Q14549 363 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCTE1Q5JU00 501 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IP6K3Q96PC2 410 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLAAQ9Y263 795 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PEX12O00623 359 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF5CO60282 957 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEACAM4O75871 244 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP1O94782 785 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCM3P25205 808 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRM7Q14831 915 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R7Q15435 360 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRGPREQ86SM8 312 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2L3Q8NG85 312 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTERQ96BW5 349 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CUTCQ9NTM9 273 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCM1Q15154 2024 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1B0GX78 115 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL8A6PVC2 850 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FNTAP49354 379 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms