RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 MFSD3Q96ES6 412 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2A14Q96R47 310 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CD180Q99467 661 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PAK5Q9P286 719 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TLK1Q9UKI8 766 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 ASF1AQ9Y294 204 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 BTRCQ9Y297 605 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 H3BMH7 237 aa7.06□□□□□ -1.28
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PRPF4B-208ENST00000490653 GPC4O75487 556 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 OR56A5P0C7T3 313 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 RORAP35398 523 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBB4BP68371 445 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKAA1Q13131 559 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 RPA4Q13156 261 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBB2AQ13885 445 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PCID2Q5JVF3 399 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CPZQ66K79 652 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PACS1Q6VY07 963 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 KMT5CQ86Y97 462 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC89Q8N998 374 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC45Q96CN5 670 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 MENTQ9BUN1 341 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CARD6Q9BX69 1037 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.06□□□□□ -1.28
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PRPF4B-208ENST00000490653 P2RY12Q9H244 342 aa7.06□□□□□ -1.28
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PRPF4B-208ENST00000490653 SYBUQ9NX95 663 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 NFS1Q9Y697 457 aa7.06□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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PRPF4B-208ENST00000490653 ARGFXA6NJG6 315 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 C2orf74A8MZ97 194 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 ISM1B1AKI9 464 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF749O43361 778 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 NRP2O60462 931 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT14P02533 472 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FTH1P02794 183 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC175P0C221 793 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 GP1BBP13224 206 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FSTP19883 344 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 AOAHP28039 575 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PTPN4P29074 926 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FMO4P31512 558 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 GRIA3P42263 894 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 NPY2RP49146 381 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 IDH3AP50213 366 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 CCL11P51671 97 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 PRAMEP78395 509 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 MC1RQ01726 317 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 KYNUQ16719 465 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 C1orf189Q5VU69 101 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 FCRL6Q6DN72 434 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 SPESP1Q6UW49 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF4B-208ENST00000490653 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.05□□□□□ -1.28
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