RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486223.1

FREM1-208, Transcript of FRAS1 related extracellular matrix 1, human

TSL 3

Gene FREM1, Length 815 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FREM1-208	ENST00000486223	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	TBX21	Q9UL17	535 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FREM1-208	ENST00000486223	STK36	Q9NRP7	1315 aa		2.59	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		2.59	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	AGRN	O00468	2067 aa		2.59	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CACNA1H	O95180	2353 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223		A0A1B0GUL7	405 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CCDC189	A1A4V9	331 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	EPOP	A6NHQ4	379 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223		A6NLC8	198 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	C19orf81	C9J6K1	198 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	GCNT3	O95395	438 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	AGR2	O95994	175 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	LIF	P15018	202 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	IL7R	P16871	459 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ABCD3	P28288	659 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ABCD1	P33897	745 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	WNT5A	P41221	380 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ACLY	P53396	1101 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	PTP4A2	Q12974	167 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	GSTA3	Q16772	222 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	MYLK3	Q32MK0	819 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	NAXE	Q8NCW5	288 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	TRPV1	Q8NER1	839 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	GFI1	Q99684	422 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	USP44	Q9H0E7	712 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SARDH	Q9UL12	918 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CLIC4	Q9Y696	253 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ELP1	O95163	1332 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	TRANK1	O15050	2925 aa		2.58	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ENTPD3	O75355	529 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CLPTM1	O96005	669 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	F9	P00740	461 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	LIPF	P07098	398 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ASGR1	P07306	291 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ASNS	P08243	561 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	FAM157C	P0CG43	387 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SHC1	P29353	583 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CPOX	P36551	454 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	TUB	P50607	506 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	MMP15	P51511	669 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	BACE1	P56817	501 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	GRB14	Q14449	540 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	METTL7B	Q6UX53	244 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	LONP2	Q86WA8	852 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	SMARCE1	Q969G3	411 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	EGLN2	Q96KS0	407 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		2.57	□□□□□ -2
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2

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