RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 GSTM1P09488 218 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 OR56A5P0C7T3 313 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 AGXTP21549 392 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CCR7P32248 378 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GSTM4Q03013 218 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TSTD2Q5T7W7 516 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 FHL5Q5TD97 284 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RHBDD2Q6NTF9 364 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 C4orf22Q6V702 233 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZNF534Q76KX8 674 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TAX1BP1Q86VP1 789 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CFAP61Q8NHU2 1237 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SNF8Q96H20 258 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SGSM3Q96HU1 749 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 IL17FQ96PD4 163 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RAB6BQ9NRW1 208 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 POLG2Q9UHN1 485 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 KRT87PA6NCN2 255 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DPM1O60762 260 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ALOX12BO75342 701 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ITGAXP20702 1163 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MAGP20916 626 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PKLRP30613 574 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 FDFT1P37268 417 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TERF1P54274 439 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RRADP55042 308 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DCDP81605 110 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 HSPA14Q0VDF9 509 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CDH17Q12864 832 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ11Q14654 390 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD22Q5VYY1 191 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 AFTPHQ6ULP2 937 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC24Q6UX98 284 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 LINC00523Q86TU6 105 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RAB43Q86YS6 212 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 IFT20Q8IY31 132 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 KRT222Q8N1A0 295 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MENTQ9BUN1 341 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A11Q9NSA0 550 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 OR6C2Q9NZP2 312 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 WHRNQ9P202 907 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.15□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 HEATR9A2RTY3 570 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 QSOX1O00391 747 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 SUN1O94901 812 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 UMODP07911 640 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 MCM3P25205 808 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF8P28908 595 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 ECHS1P30084 290 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 FOLR3P41439 243 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 GRIA3P42263 894 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 MAGEA6P43360 314 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 CARSP49589 748 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 ITGA8P53708 1063 aa12.14□□□□□ -0.47
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PRAME-212ENST00000485532 SSPNQ14714 243 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 SLC5A12Q1EHB4 618 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 C4orf17Q53FE4 359 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 DCAF10Q5QP82 559 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A15Q8IZD6 547 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 DTWD1Q8N5C7 304 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 OR4L1Q8NH43 312 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 PNPLA2Q96AD5 504 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 DHRS4Q9BTZ2 278 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 PARD6BQ9BYG5 372 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 CASS4Q9NQ75 786 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa12.14□□□□□ -0.47
PRAME-212ENST00000485532 TXLNGQ9NUQ3 528 aa12.14□□□□□ -0.47
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