RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC66Q68CR7 880 aa16.22■□□□□ 0.19
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKP4Q99569 1192 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INPPL1O15357 1258 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNMDO75829 334 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL7RP16871 459 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTGR1Q14914 329 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYH4Q9Y623 1939 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCLK1O15075 740 aa16.2■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL18O94889 574 aa16.2■□□□□ 0.18
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