RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 BCKDHAP12694 445 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ZNF24P17028 368 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MAPK1P28482 360 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MLLT10P55197 1068 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ABHD18Q0P651 414 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CTF1Q16619 201 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 HECTD3Q5T447 861 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 DET1Q7L5Y6 550 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ELMOD1Q8N336 334 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ZBTB2Q8N680 514 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KCT2Q8NC54 265 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NETO1Q8TDF5 533 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FAR1Q8WVX9 515 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NEURL2Q9BR09 285 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MROQ9BYG7 248 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 C12orf49Q9H741 205 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ASB8Q9H765 288 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CPQQ9Y646 472 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LAMA3Q16787 3333 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 EVPLLA8MZ36 301 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SEPT4O43236 478 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TSPAN3O60637 253 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 STK16O75716 305 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CCNDBP1O95273 360 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CLDN9O95484 217 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PRAMEF1O95521 474 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 IDUAP35475 653 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GRK3P35626 688 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CLDN8P56748 225 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CXCR4P61073 352 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NKX3-2P78367 333 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FAM189BP81408 668 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NPTX1Q15818 432 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GPR162Q16538 588 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CYP2A13Q16696 494 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CES5AQ6NT32 575 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 SNX20Q7Z614 316 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RDH14Q9HBH5 336 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 U3KQV3 271 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ADAMTS4O75173 837 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ZNF682O95780 498 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ALDH2P05091 517 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 JUNDP17535 347 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 CTPS1P17812 591 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PFKLP17858 780 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GDF5P43026 501 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ARF5P84085 180 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 IL1RL1Q01638 556 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 MVKQ03426 396 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 RAPSNQ13702 412 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GTF2H3Q13889 308 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 KEAP1Q14145 624 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 OXA1LQ15070 435 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 PTPRRQ15256 657 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-210ENST00000480171 GTDC1Q4AE62 458 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms