RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479012.1

LNPK-208, Transcript of lunapark, ER junction formation factor, human

TSL 1 (best)

Gene LNPK, Length 774 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNPK-208	ENST00000479012	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	ZBED4	O75132	1171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	CAPN2	P17655	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	CDH3	P22223	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MC1R	Q01726	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	PAX8	Q06710	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MIS12	Q9H081	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012		A6NCN8	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	GP1BB	P13224	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	PRKACG	P22612	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MNDA	P41218	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	NRIP1	P48552	1158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	TMEM50B	P56557	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	G2E3	Q7L622	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	GJA1	P17302	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MS4A2	Q01362	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012		Q6ZR54	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	RASL10A	Q92737	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	MED20	Q9H944	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	PANK3	Q9H999	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LNPK-208	ENST00000479012	C22orf31	O95567	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	BCL10	O95999	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	PTPN3	P26045	913 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	HLA-F	P30511	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	MTF1	Q14872	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	EPHB6	O15197	1021 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	ENTPD3	O75355	529 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	JAK1	P23458	1154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	GCH1	P30793	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	CDH13	P55290	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LNPK-208	ENST00000479012	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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