RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	GK3P	Q14409	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PGM5	Q15124	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MARK4	Q96L34	752 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TSC2	P49815	1807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MYLK	Q15746	1914 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		K7ERI5	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TADA2A	O75478	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	APOA4	P06727	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MLN	P12872	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	P4HA1	P13674	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CD19	P15391	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF12	P17014	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ACVR2A	P27037	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCND2	P30279	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TTK	P33981	857 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SERPINB5	P36952	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GP5	P40197	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MAGEA12	P43365	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NAMPT	P43490	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CD151	P48509	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ENTPD1	P49961	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CPT1A	P50416	773 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PGD	P52209	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA2	P54652	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MYL6	P60660	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HSF1	Q00613	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ID2	Q02363	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RELA	Q04206	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PRKG1	Q13976	671 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	EMC2	Q15006	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PDK1	Q15118	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TAF5	Q15542	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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