RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 GPATCH11Q8N954 259 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SMPDL3AQ92484 453 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 DLG3Q92796 817 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 VPS39Q96JC1 886 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CCDC138Q96M89 665 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 LRFN5Q96NI6 719 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PKP4Q99569 1192 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 FAM117AQ9C073 453 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PRORYQ9H606 182 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PARVBQ9HBI1 364 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 FAM60AQ9NP50 221 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-206ENST00000462743 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 E7ENX8 843 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 H3BMH7 237 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 K7ENP7 123 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RAD1O60671 282 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MT-ND3P03897 115 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF28P17035 718 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 STX2P32856 288 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ATP1A2P50993 1020 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PNLIPRP1P54315 467 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TAP2Q03519 686 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RELAQ04206 551 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 IFT20Q8IY31 132 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ESX1Q8N693 406 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF480Q8WV37 535 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 GPR22Q99680 433 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RBBP8Q99708 897 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FANCEQ9HB96 536 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PDE10AQ9Y233 779 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TIAF1O95411 115 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SLC16A8O95907 504 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CYP2A7P20853 494 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 GRIA3P42263 894 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 AP1S2P56377 157 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TMPRSS3P57727 454 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ABATP80404 500 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 VAC14Q08AM6 782 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 NAA25Q14CX7 972 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 GPR19Q15760 415 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MANEAQ5SRI9 462 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FCRL6Q6DN72 434 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TRIM73Q86UV7 250 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 OR2L3Q8NG85 312 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 OR1L3Q8NH93 324 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FBF1Q8TES7 1133 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 IFT81Q8WYA0 676 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FMO2Q99518 471 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PADI1Q9ULC6 663 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms