RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.13■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 KRT12Q99456 494 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 NLNQ9BYT8 704 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 MED16Q9Y2X0 877 aa22.13■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 B8ZZF3 427 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 HSD17B2P37059 387 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 CYP2A13Q16696 494 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 SLC30A3Q99726 388 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 EURLQ9NYK6 297 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 H3BMH7 237 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 MYO1CO00159 1063 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 HCRTR1O43613 425 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ELK3P41970 407 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 NFATC3Q12968 1075 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 TCTE1Q5JU00 501 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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PTPN4-208ENST00000460289 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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