RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 FAM117AQ9C073 453 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 HBQ1P09105 142 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 IL10RAQ13651 578 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 MORF4L2Q15014 288 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 UGT8Q16880 541 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 NLNQ9BYT8 704 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 HAUS5O94927 633 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 TTC4O95801 387 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 PSMB5P28074 263 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 NFKB2Q00653 900 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 CYP2A13Q16696 494 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 BBS9Q3SYG4 887 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 FCRL6Q6DN72 434 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 SEC14L1Q92503 715 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 EURLQ9NYK6 297 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PPV9 198 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 TTI1O43156 1089 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FKBP9O95302 570 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 ERVK-10P10266 1014 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 CUL1Q13616 776 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FAM69BQ5VUD6 431 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 RHBDD2Q6NTF9 364 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 PWWP2AQ96N64 755 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 GPR21Q99679 349 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 NAT9Q9BTE0 207 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 DHRS7Q9Y394 339 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC188H7C350 402 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 MYO1CO00159 1063 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 ERGP11308 486 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 CD200R1Q8TD46 325 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 GBP5Q96PP8 586 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 TCFL5Q9UL49 500 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 CBSLP0DN79 551 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 CBSP35520 551 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 GRIA3P42263 894 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 PAFAH1B1P43034 410 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 PMS2P54278 862 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 NCF4Q15080 339 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf189Q5VU69 101 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 PDIK1LQ8N165 341 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 OR2L3Q8NG85 312 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 INPP5DQ92835 1189 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 MIPEPQ99797 713 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 RNF14Q9UBS8 474 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 SNX7Q9UNH6 387 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FLNCQ14315 2725 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 TP73O15350 636 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 CATP04040 527 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 AGXTP21549 392 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-202ENST00000460160 GABRB3P28472 473 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms