RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 OR4E1P0C645 316 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2B6P20813 491 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CCNOP22674 350 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GADD45AP24522 165 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFA6P56556 154 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ROR1Q01973 937 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NHLH2Q02577 135 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KCNC3Q14003 757 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2SQ16763 222 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPR153Q6NV75 609 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLAMF9Q96A28 289 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CTSFQ9UBX1 484 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IRAK3Q9Y616 596 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ALG6Q9Y672 507 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GWJ7 208 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAM205CA6NFA0 338 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 K7EPK0 472 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPAA1O43292 621 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CLN5O75503 358 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNA1P02708 482 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PRKXP51817 358 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ASAH1Q13510 395 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PFKFB4Q16877 469 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UGT8Q16880 541 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR2L2Q8NH16 312 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARL11Q969Q4 196 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NPAS1Q99742 590 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 REEP2Q9BRK0 252 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF649Q9BS31 505 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PRO1933Q9H354 126 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 VWA7Q9Y334 891 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TVP23AA6NH52 213 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 H0YIN7 160 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IMPA2O14732 288 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF432O94892 652 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FGF4P08620 206 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ABHD2P08910 425 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 STAG3L2P0CL84 134 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM18P0DKX4 95 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FGF7P21781 194 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AKT1P31749 480 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PKIAP61925 76 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CREMQ03060 361 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KCNC4Q03721 635 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PMPCAQ10713 525 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KLF10Q13118 480 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SNAPC2Q13487 334 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HKDC1Q2TB90 917 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BCL7AQ4VC05 210 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.48□□□□□ -1.53
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